Посадковий модуль досліджуватиме поверхню Місяця на глибині до ~40 см. Використовуючи свої інструменти, він шукатиме вміст води, а також намагатиметься визначити, які елементи та їхні ізотопи присутні у місячному ґрунті.
Ще одною метою буде вимірювання рівня радіоактивності поверхні Місяця. «Луна-25» вивчатиме також склад екзосфери Місяця, фізичні процеси, що відбуваються в ній, що відбувається, коли Місяць перетинає хвіст магнітосфери Землі.
Усі наведені нижче інструменти були розроблені Російським інститутом космічних досліджень, який є провідною установою Російської академії наук, яка займається дослідженням космосу.
АДРОН-ЛР. Детектор нейтронів та гамма-променів Вивчення елементного складу та вмісту водню в реголіті методом активної нейтронної гамма-спетроскопії. Прилад просвітить ґрунт на глибину 60 см.
АРІЄС-Л. Енергомасспектрометр для вивчення екзосфери Місяця.
БУНІ. Блок забезпечення роботи наукових приладів. Комутація електроживлення та управління науковою апаратурою, збирання, зберігання та передача телеметричної наукової інформації та бортові системи апарату.
ЛАЗМА-ЛР. Лазерний мас-аналізатор для вимірювання хімічного, елементного та ізотопного складу реголіту.
ЛИС-ТВ-РПМ. ІЧ-спектрометр для вивчення у видимому та інфрачервоному діапазонах мінералогічного складу поверхневого шару реголіту Місяця та вмісту у ньому води.
ПмЛ. Прилад пилового моніторингу для дослідження фізичних характеристик місячної пилової екзосфери та поверхневого реголіту, що розсіюється під дією мікрометіоритних впливів.
ЛМК. Рука-маніпулятор. Буде використовуватися для доставки зразків реголіту в прилад ЛАЗМА-ЛР, вивчення механічних властивостей реголіту, наведення ЛИС-ТВ-РПМ на об'єкти поблизу апарату. Рука-маніпулятор ЛМК з ковшом грунтозабірним зможе відбирати реголіт з розміром частинок до 2,8 мм з глибини близько 15-30см.
СТС-Л. Телевізійна система. Панорамна стереозйомка, зйомка під час посадки апарату, забезпечення роботи ЛМК. На борту встановлено вісім камер СТС-Л.
Пілот-Д. Телекамера-демонстратор. Зйомка поверхні Місяця з низькою навколомісячної орбіти для відпрацювання оптичного каналу майбутньої європейської системи високоточної та безпечної посадки
